Modalités d’envoi au CNR des Staphylocoques

Envoi d'une souche

Législation

Tout transport de matériels biologiques potentiellement infectieux demeure sous l'entière responsabilité de l'expéditeur.

Les modalités de transport des matières infectieuses sont fixées par l'arrêté du 29 mai 2009 modifiant l'arrêté du 1er juin 2001 relatif au transport des marchandises dangereuses par route (dit « arrêté TMD »). Il est recommandé de suivre le Guide sur la sécurité du transport des matières infectieuses et des échantillons de diagnostic publié par l'OMS (https://www.who.int/fr/publications-detail/WHO-WHE-CPI-2019-20).

Prélèvements biologiques d'origine humaine

Du fait de la spécificité de ce type d'analyse, prendre contact avec le CNR avant tout envoi.

Vomissements

• En cas d'intoxication alimentaire, la détection d'entérotoxines staphylococciques peut être réalisée dans les vomissements des patients. Il ne faut pas faire parvenir au CNR de souches isolées de ces prélèvements. Par ailleurs, pour le diagnostic de TIAC, on rappelle qu'il ne faut pas envoyer de souches isolées de coproculture et que les aliments doivent être envoyés aux services vétérinaires après avis de l'ARS.
• Envoyer le prélèvement de vomissures dans un poudrier stérile, congelé à -20°C. Le volume minimum requis est de 10 mL, toujours après appel au CNR.

Sérum

• Prélevé sur tube sec (sérum déjà décanté de préférence).
• Envoi à température ambiante.
• Fiche de renseignements cliniques : sérologies anti-staphylococciques (TSST-1, PVL)

Les renseignements cliniques et épidémiologiques sont indispensables pour accomplir l'expertise demandée.

1. la FICHE devant accompagner tout envoi : 

2. JOINDRE L'ANTIBIOGRAMME des souches envoyées 

Fiches spécifiques : à joindre en plus de la fiche de renseignements pour analyse biologique si nécessaire :

• En cas de choc toxique : 
  
  Document

  Fiche de renseignements cliniques : chocs3.42 Mo
• En cas de pneumonie nécrosante : 
  
  Document

  Fiche de renseignements cliniques : pneumonies nécrosantes1008.44 Ko
• En cas de demande de sérologie TSST-1 ou PVL : 
  
  Document

  Fiche de renseignements cliniques : sérologies anti-staphylococciques (TSST-1 et PVL)428.68 Ko

Rendu des résultats

Les résultats des analyses sont retournés aux demandeurs par courrier dans les délais les plus brefs possibles.

Le CNR, en lien avec la Direction du Système d’Information (DSII) des HCL met en place un système de transmission sécurisée dans le cadre du projet de Télémédecine développé par la DSII pour la Direction Générale des HCL. Ce système permet un rendu en temps réel aux prescripteurs des résultats, avis spécialisés du CNR et conseils sur un serveur sécurisé « HYBRID » qui assure ainsi la sécurité et la traçabilité des résultats. Ce serveur de résultats spécifique (HYBRID) est disponible pour tous les établissements extérieurs. L’accès au serveur de résultats HYBRID peut être demandé auprès du service clientèle joignable par mail à l’adresse suivante : relationclient.lbmms@chu-lyon.fr

Le délai de réalisation moyen d’une expertise (hors clonalité) est d’environ une semaine. Dans le cadre des suspicions de pneumonie nécrosante, la recherche des gènes codant la leucocidine de Panton Valentine est réalisée dans un délai de 72h maximum à réception de la souche. Dans le cadre d’investigation d’épidémies, le délai moyen de rendu est d’environ trois semaines mais peut varier en fonction du nombre de souches et de leur arrivée.

Les résultats urgents sont communiqués par téléphone ou mail sécurisé.

Tarification

Les analyses relevant des activités de surveillance et d’expertise du CNR sont réalisées à titre gracieux, sous réserve que la fiche de renseignements du CNR soit jointe et remplie.

Protection des données personnelles

Certaines de vos données personnelles sont recueillies et font l’objet d’un traitement car elles sont nécessaires à la réalisation de recherche pour accroître les connaissances en sciences médicales et biologiques.

Cette finalité est reconnue d’intérêt public. La règlementation européenne autorise cette finalité car :

• ce traitement est nécessaire à la réalisation d’activités scientifiques,
• vos droits sont protégés, notamment par l’utilisation d’un code pour remplacer vos données d’identité dans le cadre des recherches.

Vous ne serez jamais identifié ou identifiable dans les publications des résultats de la recherche.

Toute personne dont les données médicales et administratives ont été transmises au CNR peut contacter le délégué à la protection des données pour toute information concernant le traitement de ses données. Vous pouvez exercer vos droits d'accès, de rectification, de suppression, de limitation du traitement et d'opposition au traitement de vos données personnelles en contactant le délégué à la protection des données à l'adresse suivante : dpo@chu-lyon.fr.

• Informations relatives à la recherche médicale sur données et vos droits concernant vos données personnelles

En cas de litige, vous disposez du droit de saisir la Commission Nationale de l’Informatique et des Libertés (www.cnil.fr), qui est l’autorité nationale de contrôle des traitements de données à caractère personnel.

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