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Les réseaux européens de référence ont pour objectif de remédier aux difficultés des professionnels à poser un diagnostic et à dispenser des soins hyperspécialisés en cas de maladies complexes, rares ou à faible prévalence. 28 équipes HCL, labellisées centre de référence maladies rares ou centre cancers rares, sont membres de 17 réseaux différents. Les HCL coordonnent l'ERN Epicare.