LBMR Nocardiose

Les missions du LBMR Nocardiose

1.   Mission d’aide au diagnostic en réalisant la recherche de Nocardia pas PCR directement sur prélèvements cliniques

2.  Mission d’expertise des isolats cliniques de Nocardia :

• Identification par biologie moléculaire (PCR 16S et séquençage)
• Réalisation des antibiogrammes par technique en microdilution et interprétation selon les recommandations CLSI 2018    

Les échantillons (prélèvements ou souches) doivent être accompagnés de la fiche de demande.

L’adresse d’envoi est la suivante :

Hospices Civils de Lyon

Institut des Agents Infectieux (IAI)

Groupement Hospitalier Nord, Bâtiment O – CBPN

103 Grande Rue de la Croix-Rousse

69317 Lyon Cedex 04

France

Tarifs

• Tarif PCR Nocardia : si résultat négatif BHN N134 - PCR classique ou temps réel (250.0 BHN) soit 65.00 euros
• Tarif PCR Nocardia : si résultat positif BHN N134 - PCR classique ou temps réel (250.0 BHN) soit 65.00 euros, suivi de BHN N140 - forfait séquençage à partir de produit d’amplification (610.0 BHN) soit 158.60 euros
• Tarif identification souche : BHN N115 - identification d’espèce bactérienne par PCR suivie de séquençage Sanger  (510.0 BHN) soit 132.60 euros
• Tarif antibiogramme : B 60 - réf 0274 x 5 soit 78.00 euros

Prestation de conseil

Des avis d’expertise microbiologique et de prise en charge thérapeutique sont formulés sur demande par l’équipe des biologistes du LBMR, en collaboration avec le Service de Maladies Infectieuses et Tropicales des HCL et le Pr. David Lebeaux, Maladies infectieuses et tropicales AP-HP

La Nocardiose

Les espèces du genre Nocardia sont des pathogènes opportunistes. Elles affectent principalement les sujets immunodéprimés, mais l'observation de cas en l'absence apparente de facteur prédisposant n'est pas exceptionnelle. En raison de la nature et de la gravité des infections dont elles sont responsables, l’identification rapide au niveau du genre et de l’espèce s’impose afin de réaliser les adaptations thérapeutiques qui constituent un facteur crucial d’évolution pour les patients.

L’infection à Nocardia a tendance à disséminer. Le système nerveux central représente la localisation métastatique la plus fréquente. Il est donc important de noter que la découverte d’une forme pulmonaire doit amener le clinicien à réaliser un bilan d’extension avec recherche de formes cérébrale, cutanée ou polyviscérale.

La recherche de Nocardia doit être effectuée principalement par culture, en ensemençant des milieux adéquats. Pour un diagnostic rapide et/ou en cas d’infection décapitée, des recherches par PCR spécifiques Nocardia peuvent être entreprises. Après culture, la spectrométrie de masse de type MALDI-TOF permet une identification rapide et fiable des principales espèces et facilite l’adaptation thérapeutique. L’antibiogramme est nécessaire pour déterminer le profil de sensibilité aux antibiotiques compte tenu de la variabilité des phénotypes. En cas de nocardiose disséminée, la nécessité d’une  antibiothérapie longue et la potentielle survenue d’effets secondaires nécessitent le recours à des alternatives dont le choix doit être guidé par l’antibiogramme.